O treinador João Paulo deixa o Comercial mesmo antes do inicio da temporada de 2012. João Paulo comandou o time do Vila Nova na campanha de 2011, levando a equipe tricolor até a grande final. O treinador que está começando a sua carreira, afirmou que vai dar um tempo e que não assume outro compromisso no momento. Ele no primeiro dia de transferências ao lado de Dalmer, Caio e Raul, todos do Vila Nova assinaram com o Comercial. João Paulo é funcionário da escolinha do Willams Batista e para não conflitar trabalhar no espaço do Vila Nova e treinar um grande do nosso amador, optou por dar continuidade no trabalho das categorias de base. Resta saber se o Comercial vai manter o trabalho de Fernando, outro jovem treinador cobiçado por equipes do nosso amador.